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熒光定量pcr儀做蛋白質(zhì)熱穩(wěn)定性分析實驗
2024-06-28 15:24:15 作者: 高思維醫(yī)療 1300

研發(fā)類實驗室常常涉及到功能蛋白質(zhì)熱穩(wěn)定性分析及蛋白質(zhì)間相互作用的分析。比如在科研中對蛋白純化、結(jié)晶和功能鑒定中要選擇穩(wěn)定蛋白的配體或緩沖條件;科研或工業(yè)上選擇蛋白較好的儲存條件;藥物開發(fā)中對配體或藥物靶點進行高通量篩選。針對以上研究領(lǐng)域,一種穩(wěn)定高效高通量的研究方法正在被相關(guān)研究者廣泛采用,即FRET蛋白質(zhì)熱穩(wěn)定性分析。

Bio-Rad針對蛋白熱穩(wěn)定性分析實驗,提供完整的解決方案。該方案采用差示掃描熒光(differential scanning fluorimetry,DSF)技術(shù):反應(yīng)體系中加入熒光疏水染料Sypro Orange,蛋白自有疏水區(qū)結(jié)構(gòu),在緩慢升溫的過程中,蛋白的結(jié)構(gòu)會被打開,暴露出疏水區(qū),熒光疏水染料Sypro Orange就可以與該區(qū)域進行特異性結(jié)合,設(shè)備提供該反應(yīng)的溫度變化及熒光信號采集,類同于熒光定量pcr反應(yīng)。


DSF技術(shù)原理

在有特定化合物或配體結(jié)合的情況下,蛋白穩(wěn)定性會發(fā)生變化,表現(xiàn)為熔解溫度的變化。不同蛋白將有著不同的thermal shift(蛋白熱熔解曲線)圖像,每一個都有獨特的熔解曲線形狀、斜率和溫度熔解范圍。據(jù)此特性,可借助熒光定量PCR儀來進行該實驗。前提是熒光定量PCR儀具備Sypro Orange特異的激發(fā)檢測通道。

Bio-Rad Opus系列熒光定量PCR儀自帶專用檢測通道FRET,激發(fā)光波長450-490nm,發(fā)射光波長560-580nm,正適合于用SYPRO Orange熒光染料標(biāo)記進行蛋白溶解曲線分析。在熒光定量PCR儀上緩慢加熱蛋白質(zhì)樣品,在加熱的過程中檢測熒光染料與結(jié)構(gòu)發(fā)生改變的蛋白質(zhì)相結(jié)合的量,來評價蛋白質(zhì)的熱穩(wěn)定性.該方法具有數(shù)據(jù)準(zhǔn)確,高通量,蛋白質(zhì)樣品損耗較小和溫度變化范圍廣的優(yōu)點,應(yīng)用領(lǐng)域包含:

(1)篩選樣品蛋白熱穩(wěn)定性;

(2)高通量篩選配體與蛋白的結(jié)合;

(3)篩選能與蛋白靶點結(jié)合的小分子、片段文庫候選藥物;

(4)篩選能與蛋白靶點結(jié)合的抗體;

(5)篩選點突變后樣品的蛋白穩(wěn)定性變化;

(6)尋找合適/緩沖液條件,以測定蛋白與配體間相互作用;

(7)尋找合適緩沖液條件,以改善蛋白的純化、分離;

(8)篩選合適/緩沖液,以鑒定成功的蛋白結(jié)晶條件;

(9)篩選緩沖液,以鑒定出蛋白儲存條件。

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