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如何判定qPCR的數(shù)據(jù)可不可用?
2024-08-13 09:13:23 作者: 高思維醫(yī)療 1901

在進行qPCR實驗后,所得到的數(shù)據(jù)是否可靠,是一個值得關(guān)注的問題。如果數(shù)據(jù)不可靠,就算趨勢符合預(yù)期,也不應(yīng)當(dāng)使用。

如何判斷qPCR數(shù)據(jù)是否可用

第一步:Ct值的評估

Ct值是判斷qPCR數(shù)據(jù)質(zhì)量的關(guān)鍵指標(biāo)。以下是Ct值的一般標(biāo)準(zhǔn):

1、:內(nèi)參基因的Ct值在14-18之間,目的基因在14-18之間。

2、良好:內(nèi)參基因的Ct值在12-20之間,目的基因在14-32之間。

3、勉強可用:內(nèi)參基因的Ct值在10-22之間,目的基因在14-35之間。

如果目的基因的Ct值超過了35,雖然數(shù)據(jù)仍然可以使用,但可能會對實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性產(chǎn)生影響,結(jié)果可能偏差很大。因此,如果Ct值偏高,建議重新進行實驗。

第二步:溶解曲線的檢查

Ct值之后,我們需要仔細檢查溶解曲線:

1、熔點(TM):應(yīng)在75-90°C之間。

2、峰型:應(yīng)為單峰,無雜峰。

3、峰距:理想情況下,峰距應(yīng)在5個Tm單位內(nèi)。

第三步:擴增曲線的觀察

雖然擴增曲線可能不是大家經(jīng)常關(guān)注的點,但它同樣重要:

1、平臺期:曲線應(yīng)有清晰的平臺期。

2、熒光強度(Fluorescence):至少應(yīng)在3以上。

3、二次抬頭:曲線不應(yīng)出現(xiàn)二次上升。

在大多數(shù)情況下,只要前兩個依據(jù)(Ct值和溶解曲線)沒有問題,你們就可以大膽地進入下一步進行數(shù)據(jù)分析。但為了確保數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性和可靠性,建議在完成qPCR后,也留意一下擴增曲線。

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